心胸外科是“兰州军区心血管病专科中心”，中国红十字会 “爱心工程胡大一爱心志愿服务队新疆志愿者服务分站”，新疆医科大学心外科硕士研究生培养点，1995年与北京阜外心血管病医院正式协作成立心血管病技术协作中心。是以心脏、普胸为主要业务范围的综合科室，在诊断、手术、体外循环、重症监护水平方面在新疆地区具有较大影响。年门诊量2000余人次，收容量 1000人次。目前已完成心脏手术近3000例，年完成各类心脏手术200-300余例。近年来，开展各项新技术、新业务100余项，发表论文130余篇，获军队医疗成果奖5项，自治区科技进步奖一项，填补了几十项新疆及军队心脏手术空白。 　　多年来，与国内外心脏外科界进行广泛交流，先后举办了空军胸心外科学习班、全国改良低温心脏手术学习班，成功举办了第四届中美心血管外科新技术研讨国际会议，与美国、澳大利亚、德国等心外科同行共同学习进步，使心脏病患者不必走出新疆，就能够得到很好的救治。尤其克服了新疆患者到内地治病、住院、生活不习惯等诸多困难，节省了交通、治疗和生活花费。 　　2011年4月21日下午，由我院心胸外科和市友谊医院神经外科筹备，乌鲁木齐市28位从事心胸外科工作的专家同仁齐聚乌市美丽华大酒店，庆祝乌鲁木齐市第一届心胸外科专业委员会的成立。会议选举产生了乌鲁木齐市首届心胸外科专业委员会主任委员1名，副主任委员4名，秘书长1名。 　　科室拥有设备先进的重症监护室，拥有全套床旁德国Hading及太空生命体征监护系统，可对患者进行24小时不间断的全面连续监测，拥有9台德国西门子900-C呼吸机，几十台微量泵，床旁供氧、负压吸引、拍片、B超等配套设备。体外循环拥有德国STOCKERT-SHILLY 人工心肺机，全套监护系统，德国STOCKERT-SHILLY　Ⅲ型变温设备，床旁ACT检测仪，Drager呼吸机等诸多大型精密设备。国际一流的层流无菌手术室、体外循环机、全自动变温箱、西门子麻醉机、菲利普大型X线数字减影血管造影机(DSA)、核磁共振、螺旋CT等先进设备全院共享。