肛肠科是医院乃至全疆影响力最大的、最有中西医结合特色的治疗肛肠病的专科，属自治区重点专科建设项目。科室技术力量雄厚，不仅拥有一批成果卓著、医术高明、经验丰富的知名专家，而且有一批中青年专家迅速成长。目前分为肛肠一科和肛肠二科。共有医护人员26名，其中医生12名，护士14名。医生中主任医师1人，副主任医师5人，主治医师5人，住院医师1人，硕士研究生8名，现有固定床位44张，常住院病人100人左右。每年有几十名全疆各地进修人员到本科学习，已批准设立硕士研究生点。 　　目前科室形成了具有中医特色、中西医结合治疗肛门大肠疾病有特色的科室，特别在一些疑难病上有较大的优势，如大剂量中药保留灌肠治疗非特异性溃疡性结肠炎；中医药治疗习惯性便秘；直肠阴道瘘修补；陈旧性会阴Ⅲ度撕裂修补；直肠癌Miles、Dixon手术；结肠癌切除；高位复杂性肛瘘部分切开挂线术；环形混合痔分段保留齿线切除术；肛门直肠脓肿内口定位根治术；直肠脱垂点状、柱状综合治疗术等。同时本科还开展了术后疼痛干预疗法，基本上能达到肛门部手术术后无痛的效果。本科有电子纤维结肠镜，乙状结肠镜，肛管直肠压力测定设备、痔科套扎器以及微波治疗仪等先进医疗设备，能够满足肛门大肠疾病的诊断与治疗。 　　肛肠科全体医护人员将继续努力，以“一流的技术、一流的设备、一流的服务”为宗旨，以雄厚的综合实力为患者提供领先水平的，全方位的医疗服务。