耳鼻咽喉科为南通市重点专科，1994年10月率先在南通市开展鼻内窥镜微创技术，经过10多余的努力，已由最初单纯治疗鼻窦炎、鼻息肉扩展到大部分鼻科领域，包括鼻出血的治疗，鼻中隔矫正，鼻中隔穿孔修补，鼻内窥镜下脑脊柱鼻漏修补术，各种鼻腔、鼻窦良性肿瘤的摘除等；开展过敏性鼻炎的检测及免疫治疗；开展耳鼻咽喉恶性肿瘤的手术切除；开展中耳炎的手术治疗等，获本科技进步奖四项，省卫生厅新技术引进奖一项，举办市耳鼻咽喉科学术会议二次。