心胸外科是淮安市第一批市级重点科室，现有床位96张，包括ICU床位12张，配备心电监护仪20余台、进口呼吸机7台、德国进口人工心肺机1台、除颤仪2台、主动脉球囊反博机1台、起搏器1件、微量泵40个。上世纪60年代独立组建普胸外科，1983年始开展心脏外科手术。历经几代专家不懈努力，本科室享誉苏北地区，为省卫生厅心胸外科质量控制成员。今年心脏外科年手术例数突破170例，其技术水平走在地市级中心医院前列，成为苏北大地一颗耀眼的明珠。 　　普胸外科：年手术数量达1500例，在江苏省位列前茅。开展食管Ca根治胃代食管、结肠代食管术;全喉全颌切除治疗咽颌上段Ca;贲门Ca根治，肺段、肺叶、双叶、全肺切除术，肺Ca支气管袖式、支气管动脉双袖式切除，心包内切除术，隆突成形术，纵隔肿瘤、胸腺瘤合并重症肌无力的手术治疗，各种严重复杂胸部外伤，多发伤，急性呼吸窘迫综合征(ARDS)，心脏损伤等危重病人的救治。电视胸腔镜下肺部分切除、肺大泡切除、脓胸、血胸探查、止血、引流，胸膜、肺的活检、纵膈肿瘤切除术等，此技术是进几年开展的新技术项目，手术创伤极小，恢复快。 　　心脏外科：2001年与韩国高丽大学合作建立全国第一家中韩心脏病研究所。常规开展体外循环心内直视手术。先天性如：右室双出口，复杂、重症法洛氏四联症，三尖瓣下移畸形，房室隔缺损，肺静脉异位引流，房缺、室缺，动脉导管未闭，肺动脉瓣狭窄的矫治。后天性如：风心病联合瓣膜病行双瓣膜、主动脉瓣、二尖瓣人工瓣膜置换;冠心病冠状动脉搭桥术，主动脉夹层动脉瘤手术等复杂心脏大血管手术。医疗技术水平达先进地市级医院水平。