昌吉州人民医院呼吸内科成立于2003年8月18日，是昌吉地区唯一的呼吸系统专业化科室，集临床、科研、教学为一体。科室就医环境舒适优雅，服务态度优良,设备先进，具有雄厚的技术力量，形成了科学的医疗梯队。目前为医院重点科室。科室建立了支气管镜室、肺功能室、睡眠监测室三个临床实验室和重症抢救单元。积极开展科研工作，在学术带头人王慧同志的带领下科技成果分别获自治区科技成果奖、2006、2007、2008、2009年度昌吉回族自治州科学技术进步奖二等奖3项、三等奖1项，并多次获院级新技术、新项目奖等。撰写论文数篇，近三年获自然科学优秀学术论文奖一等奖3项、二等奖2项，三等奖1项。