心胸外科目前能开展各类常见胸科疾病的常规及腔镜手术。并能开展较复杂的心脏外科手术，包括先天性心脏病、风湿性心脏病冠状动脉搭桥、心脏移植术等。对严重胸部外伤、创伤性ARDS、多发伤等的抢救治疗成功率高，位于省内先进行列。普通胸外科手术，包括气胸、胸腔积液的治疗;食管癌、贲门癌、贲门失迟缓症、食管平滑肌瘤、膈疝的手术治疗;肺癌、胸壁肿瘤、纵隔肿瘤的手术治疗;漏斗胸、鸡胸的矫形治疗;胸腔镜下肺大疱切除术、肺癌根治术、食管癌根治术;食管胃吻合口狭窄扩张术、食管支架治疗等治疗项目。心脏外科手术,包括动脉导管未闭、房间隔缺损、室间隔缺损，法乐氏四联征、心内膜垫缺损、右室双出口等复杂型先天性心脏病的诊治;二尖瓣、主动脉瓣等风湿性心脏病的瓣膜置换、联合瓣膜置换、瓣膜成形治疗;冠状动脉搭桥手术等冠心病的诊治。2000年6月9日成功完成了安徽省第一例心脏移植手术。安徽省首例心脏移植术、心肌梗塞左心室室壁瘤切除、单房心心内桥治、儿童瓣膜置换在我院成功实施。完全性心内膜垫缺损及三房心心内矫治、多瓣膜联合置换、双瓣膜联合置换三尖瓣成形术、完全性肺静脉异位回流心内矫治、右室双出口畸形矫治、先天重症紫绀心脏病合并风湿性辨膜病联合矫治、冠脉搭桥术在省内处领先地位。