呼吸科主要诊治各种呼吸系统疾病，尤其对慢支、肺气肿、肺心病、哮喘、急性呼吸窘迫综合症(AR-Ds)、肺癌、大咯血、呼衰、心衰、肺脓肿、肺结核、胸膜炎、支扩等疾病的诊治。 　　呼吸科拥有纤维支气管镜实验室和肺功能实验室，开展各种纤支镜引导下的肺肿瘤活栓、肺泡灌洗(BALF)。 　　呼吸科科室特色： 　　1、主要诊治各种呼吸系统疾病，尤其对慢支、肺气肿、肺心病、哮喘、急性呼吸窘迫综合征(ARDS)、肺癌、大咯血、呼衰、心衰、肺脓肿、肺结核、胸膜炎、肺结核病、支扩等疾病的诊治。 　　2、开展各种纤支镜引导下的肺肿瘤活栓、肺泡灌洗(BALF)术、胸腔闭式引流术、B超引导下各种介入诊治技术、CT引导下各种介入诊治技术、肺功能测定尤其对小气道肺功能测定研究。 　　3、呼吸科属省重点科室，是安徽医科大学硕士培养点，并承担南京军区呼吸专业、省呼吸专业、省防痨专业及省肺癌专业临床科研教学工作。