蚌埠医学院附属医院输血科成立于1997年9月，此前系检验科血库。2003年2月9日经蚌埠医学院院字【2003】11号文批复同意，将血库改为独立设置的输血科，并于2010年10月18日搬迁至新址（制剂楼六楼），目前科室建筑面积约600平方米，设有取发血室、配血室、贮血室、血液入库室、患者自体血采集室、治疗室、血型参比室、资料室、会议室、临床输血学教研室、值班室、库房、清洗消毒室及污物间等。科室工作在张军主任的领导下，由科秘书、质量管理小组和供血服务小组共同负责。 　　蚌埠医学院附属医院输血科现有工作人员14名，其中专业技术人员12名。专业技术人员中主任技师2名、副主任技师1名、主管技师3名、检验师3名、检验士3人。学历：硕士2人、安医大研究所课程班2人、本科6人、专科1人及中专1人。 　　蚌埠医学院附属医院输血科建科后陆续配置了贮血专用冰箱、贮试剂专用冰箱、贮标本专用冰箱，-30℃低温贮血冰箱，血浆融化仪，自动平衡离心机、血型血清学专用离心机，热合机，ORTHO AutoVue、HAMILTON全自动血型及配血分析系统及自体血回收机等一大批先进的仪器设备。 　　蚌埠医学院附属医院输血科科研课题有“冰冻富血小板血浆的实验研究与临床应用”、“人脐血源间充质干细胞（UC-MSCs）对特发性血小板减少性紫癜患者淋巴细胞CD4+CD25+Treg影响的研究”；近年来1人获安徽省科技进步三等奖1次、1人获蚌埠市科技进步一等奖1次、1人获蚌埠市百名“诚信服务明星”、1人获院“十佳”工作者荣誉称号、多人获院“先进工作者”和学院“教学先进”称号，共发表学术论文40余篇。