常熟市第二人民医院神经内科是常熟市临床脑科医学中心定点于二院，分设神经外科、神经内科两大专业。神经内科是苏州市、常熟市临床重点专科，创建于上世纪90年代初，并与上海脑血管病研究所联合成立了常熟市中风防治中心。对大量脑出血、脑室出血、蛛网膜下腔出血、脑卒中伴情感障碍、帕金森病及癫痫等进行了一系列的临床研究工作，急慢性脑血管病、癫痫、肌肉疾病、帕金森病及神经症的诊治技术在本市处于领先地位。1998年率先在本市开展了微创钻颅血肿引流术治疗脑出血和脑室出血，至今已达500多例，成为全国的协作医院。 　　神经内科，2001年至今，在本市率先开展了神经心理测评，脑脊液细胞学检查，神经电生理检测，中央视频神经监护、动态/视频脑电图检测。目前成功开展了全脑血管造影及脑血管病的溶栓治疗及介入治疗，并成立了卒中单元，使脑血管病患者得到更有效、更规范的诊治。10多年来成功治疗病人达10000余例，年专科门诊达15000多人次。获得苏州市级科技奖2项常熟市级科技奖4项，目前承担着多项省、市科研项目，成为本地区脑血管病及其他神经科疾病的研究、预防、治疗基地。