传染科成立于1980年，病房开放床位仅30张，后发展成为独立二层楼，床位达60余张，2003年“非典”暴发流行后，为适应新形势下传染病的控制、隔离和治疗。医院征地30余亩建成一所拥有100张床位并具有现代化设施的传染病医院，形成了一所集医疗、科研、教学全面发展的先进传染病医院。现传染病医院共有职工100人，医疗技术人员80人，其中主任医师2人，副主任医师3人，主治医师10余人。 　　病毒性肝炎是发病率高、危害性大、难治愈的一种传染病， 医院对本病的诊疗有独到之处，尤其是慢性乙型、丙型病毒性肝炎的诊治。多年来，医院对乙肝、丙肝的发病机制，尤其对病毒的复制过程、调控机制进行深入的研究，并通过大型生化分析仪、乙肝病毒血清学指标、DNA定量及丙肝病毒RNA的检测，对不同类型的慢性乙肝、丙肝采取不同的治疗方法。 　　传染病科承担了手足口病、甲型H1N1流感等突发卫生事件的处理工作。2008年医院被确立为手足口病定点医院，负责收治全市绝大多数手足口病及重症手足口病患儿。