小儿心胸外科2001年10月组建，与小儿心脏病外科治疗相关的20余名医护人员均在国内最大的小儿心脏病治疗中心(上海交通大学附属上海儿童医学中心)的各专业进修学习。 　　2001年12月开始临床工作，近10年来已完成小儿心血管手术2500余例，特别是2011的前六个月就已完成体外循环手术260余例。几乎包括了所有的先心病种，总体手术死亡率≤2%。其中，年龄在3岁以下者占75%，婴儿占41%。就室间隔缺损一种疾病，我科手术6个月以下的小婴儿达400例，其中最小体重2.6㎏，最小年龄28天。 　　同时，小儿心胸外科积极进行临床科研活动，已在国家级医学专业杂志上发表论文20余篇。2005年以来，获得安徽省卫生厅科研课题三项：“婴幼儿法洛四联症的外科手术治疗”、“微创胸腔镜辅助技术(NUSS术)治疗儿童漏斗胸”、“大动脉调转术治疗婴儿、新生儿的完全性大血管错位”。 　　小儿心胸外科医疗技术已达国内先进水平，特别是在小婴儿、低体重的手术治疗数量、质量上更为突出，明显体现了小儿特色，在省内形成了手术治疗婴幼儿先心病的优势。在全国，自2005年以来连续在56家儿童医院中排前10名。在省内，科室2005年获“安徽省总工会模范班组”;2007年获“安徽省重点发展学科”，并在2011年通过了安徽省卫生厅为期三年的验收。一个只有10年历史的小儿心胸外科有这样的发展速度在全国还是不多见的。 　　目前，心胸外科普通床位17张、重症监护床位6张、6套美国惠普监护系统、六台德国Dräger或西门子小儿专用呼吸机等，相关的医疗设备已达国内先进水平。同时，紧紧跟踪和应用国内、外对小儿先心病诊治的最新理论、最新知识、最新技术，把新生儿、婴儿(≤1岁)等小年龄或低体重(≤10公斤)患儿的手术治疗作为重点发展方向，建立了强有力的综合医疗班子，在人员和设备配置上充分体现小儿专业和专用的要求，应用膜肺、超滤技术、呼气末二氧化碳监测等，从根本上保证了手术质量。小年龄(≤1岁)、低体重(≤10㎏)与大龄儿童在病理生理、手术操作、转流技术、术后监护等方面有很大的不同，治疗难度相对较大、手术死亡和并发症的发生率也相对较高，特别是新生儿和小婴儿(≤6个月)，它在一定程度上代表了小儿先心病的外科诊治水平。