心胸外科是重点学科。它是首次在鄂尔多斯高原亮起的一颗璀璨明珠。心血管外科的发展拉动了其他学科的发展，因此在创建“三甲医院”的过程中占有十分重要的地位。 　　心胸外科科室技术力量雄厚，设备先进，服务周到。全科7名医师，12名护士（师）。其中主任医师2名，主治医师2名，住院医师3名。全科培养出10名心脏外科ICU专科护士（师）。医院投资300多万元购置进口体外循环机、麻醉机、呼吸机、监护仪等。科内设有心脏外科ICU病房。 　　心胸外科获省部级科技进步成果叁等奖2项，市级地区科技进步二等奖1项，三等奖1项。已登记正在进行的自治区科研成果一项，发表在中华、省级核心期刊专业论文41篇。 　　心胸外科领域完成了重症复杂紫绀型先心病法乐四症，右室双出口，完全型房室管畸形，重症三尖瓣下移畸形，完全型肺静脉导位引流等复杂先心病矫治术，老龄重症心脏联合瓣膜病合并冠心病双生物瓣替换加冠状动脉搭桥术和冠心病冠状动脉搭桥术等多项复杂高难度手术。 　　心胸外科主动脉外科有主动脉根部替换术，主动脉弓部替换术和B型主动脉夹层全被膜支架隔绝术，而重症复杂紫钳先心病畸形矫治术和重症心脏联合瓣膜病合并冠心病施行双生物瓣替换加冠脉搭桥术以及深低停循环全主动脉弓部替换术代表了心脏外科三个领域最高水平。科室开展的心脏微创外科房间隔缺损介入封堵术和主动脉介入支架结合外科搭桥（Habriy技术），是当今外科杂交技术的新趋势。主动脉外科手术的开展不仅是我院重点学科重要组成部分，而且在自治区内占有十分重要的地位，独具特色。此项新技术率先为自治区大血管外科进入全国先进行例作了良好开端。截至2007年5月中旬心脏外科已完成各类心脏外科手术597例，手术治愈率99.17%。心血管外科的创立和发展完成了历史的要求，圆满了人民的需要，提升了医院地位和知名度。 　　心胸外科胸外科方面完成了气管隆凸切除成形，支气管袖状切除成形术，复杂纵隔肿瘤切除联合肺叶和心包部分切除自体心包架桥成形术。颈及胸上段食管癌切除联合一侧甲状腺全切除加颈清扫术，食管内翻拔脱术，胸外科治愈率达98.3%。