消化内科成立于上世纪七十年代末，设有小儿消化专科病房、专科门诊和电子胃镜室，配有计划编制病床41张，拥有专业医师12人，其中高级技术人员4人，中级技术人员5人，主管护师3人，护师4人，硕士4人，博士1人，多人分别在国内知名医院受过专业培训，具有丰富的临床经验和扎实的医学理论基础以及优良的医德医风。 　　消化内科配备了小儿电子胃镜、24小时动态胃酸监测，13碳尿素呼气试验检测仪、电子肠镜、彩超、胃肠钡餐摄影仪、全自动生化分析仪、荧光定量PCR仪等，开展了幽门螺杆菌检测、轮状病毒、腺病毒、乳糖不耐受、食物过敏、巨细胞病毒感染的临床研究和静脉高营养在小儿消化系统疾病中的应用。小儿电子胃镜从2002年开展以来，已作为常规诊断技术用于临床，并开展了胃镜下取消化道异物、胃扭转复位、镜下止血、食道狭窄扩张治疗食道裂孔疝、喷门失弛缓、食道狭窄、食道闭锁、幽门前瓣膜狭窄的诊断，胃镜对腹型过敏性紫癜在皮疹未出现之前早期诊断的临床应用。目前接受胃镜检查的患儿最小年龄为8天。该科与外科合作开展了腹腔镜在婴儿阻塞性黄疸中的应用及先天性胆道闭锁的诊断。 　　消化内科担负着全省小儿胃肠及肝胆胰等消化系统疾病的诊治和临床研究，尤其在长期反复呕吐、腹痛、腹胀、黄疸、便血、便秘、厌食症及消化道畸形的诊治; 难治性腹泻病伴水电解质紊乱(包括坏死性小肠结肠炎，蛋白丢失性肠病，肢皮炎性肠病，过敏性胃肠炎，嗜酸细胞性胃肠炎、炎症性肠病等);胃食道反流、食道炎、食道静脉曲张、急、慢性胃炎，消化性溃疡;上、下消化道大出血的抢救;婴儿肝炎综合征(包括巨细胞病毒性肝炎、EB病毒性肝炎等非嗜肝病毒性肝炎);胆红素代谢障碍性疾病、胆汁淤积综合征，肝豆状核变性，糖原累积病等代谢性肝病;胆囊炎，胆管炎、胰腺炎以及门静脉海绵样变等疾病的诊治等方面积累了丰富的临床经验，同时还开展了巨细胞病毒感染相关神经性耳聋的监测和早期干预的临床研究及小儿无痛胃镜的检查。