血液科是江苏省省级临床重点专科（2002年，2009年顺利通过复评），是南医大硕士学位授予点。“十一五”期间南京医科大学重点学科。有医、护、技人员45人，其中江苏省“135工程”优秀医学人才1人，省“333工程”培养对象2人，淮安市“十百千工程”第一层次培养对象1人，第二层次培养对象1人，第三层次培养对象2人；高级职称7人，中级职称1人，初级职称3人；核定床位48张(实际开放 70 张)，其中百级层流病房2张。年门诊量5500余人次，年出院病人1700余人次。拥有先进的血液专科实验室，为淮安市及周边县市血液病的诊治中心、淮安市血液病学、科、研和教学基地。对各种常见及疑难重危血液病的诊治有丰富的经验。1990年率先在苏北地区开展了自体骨髓移植治疗血液恶性肿瘤，此后陆续开展了自体外周血干细胞移植、异基因干细胞移植，脐血干细胞移植，半相合干细胞移植治疗白血病及及其他恶性肿瘤、是首批获得江苏省异基因干细胞移植资质的七家医院之一。1996年在国内率先采用高三尖杉酯碱治疗慢性粒细胞白血病，应用MEA方案治疗急性非淋巴细胞性白血病，雷公藤多甙治疗重型再生障碍性贫血等，取得了较好的疗效，并被国内多家医院采用。目前能开展急性白血病的现代诊断技术（MICM分型）及规范化治疗；恶性淋巴瘤的现代诊断技术（免疫组化、染色体）；难治性出血性疾病的诊断及规范化治疗；重型、 难治型再生障碍性贫血的诊断及规范化治疗；骨髓增殖性肿瘤（MPN）诊断及规范化治疗；大剂量化疗、异体和自体外周血干细胞移植、脐血干细胞移植治疗白血病及恶性淋巴瘤、血浆置换术、供者淋巴细胞输注、骨髓基质干细胞治疗急性心肌梗塞和脑梗塞、CIK免疫细胞治疗恶性肿瘤等先进技术，疗效达国内先进水平。