消化内科为我院专科建设起步最早的重点专科之一，经过几代人的努力和多年的发展，现已形成集消化科门诊（专科、专家门诊）、住院病房和消化内镜中心为一体的临床专科体系，承担南京医科大学理论教学任务，以及南医大等医学院校临床实习带教工作。2012年在南京市医学重点专科第七周期评审中被评为南京市重点专科。 消化内科人才梯队合理，现有专科医生14名，其中高级职称4名，中级职称4名；硕士研究生7名，有多人先后前往上海、南京等三级医院消化科进修深造。设有病床48张，年门诊量近7万人次，年住院近2000人次。该科技术实力雄厚，善于学习和应用国内外先进诊疗技术，擅长消化系统各类疾病的诊治，尤其对慢性胃炎，消化性溃疡、消化道出血、胆石症、急性胰腺炎、肝硬化、消化道肿瘤、溃疡性结肠炎等疾病具有较强的诊疗能力；对难治性溃疡、顽固性胃炎、原发性胆汁性肝硬化等也有一定的诊疗经验。 消化内镜中心拥有先进的电子胃镜、肠镜、十二指肠镜、超细胃镜、超声内镜及相关辅助设备，常规开展经鼻超细胃镜、无痛胃镜及肠镜、超声胃肠镜检查及各种镜下治疗，年胃镜下诊疗万余人次；年肠镜下诊疗2500余人次。内镜下治疗已成为消化内科的特色技术，常规开展内镜下胆管取石术（ERCP），消化道息肉、腺瘤氩气、圈套器电凝电切摘除术，消化道癌前病变及早癌内镜下粘膜切除术（EMR）和内镜下粘膜剥离术（ESD），消化道异物取出术，食管胃底静脉曲张套扎术及组织胶注射术，食管、贲门、胃十二指肠、结肠良恶性狭窄扩张及支架置入术，胰腺癌、胆管癌支架置入术，鼻空肠营养管放置术，晚期消化道肿瘤化疗粒子植入术，经皮胃造瘘（PEG），原发性肝癌肝动脉介入栓塞术（TACE），经皮经肝胆管引流术(PTCD)等多项技术。消化科门诊开展13C 、14C呼气试验，无需胃镜检查即可检测胃内是否有幽门螺杆菌感染。