扬州友好医院病理科由江苏省知名病理学专家杨邦杰教授领导，有4名医技人员，其中正教授1名，高年资主治医师2名，技师1名。拥有一批先进的病理设备，如轮转切片机（MICROM—HM340E）、包埋中心（SAKURA）、冷冻切片机（LEICA—CM1900）、病理图像采集系统等。开展组织病理学诊断、手术中快速冷冻切片诊断、液基细胞学（TCT）诊断、细针穿刺诊断以及组织化学与免疫组织化学技术。 　　扬州友好医院病理科与江苏省中医院病理科/国家中管局三级分子实验室合作，于2012年5月26日成立“江苏省癌症基因中心扬州分部”、“扬州友好医院临床基因转化应用中心”、“肿瘤个体化治疗病理中心”，在扬州、泰州地区率先开展基因检测。 　　扬州友好医院病理科基因中心提供胃癌、肠癌、肺癌、乳腺癌等多种肿瘤的多项基因检测，指导肿瘤患者进行分子靶向治疗和个体化化疗药物的选择，使治疗更有针对性，提高治疗效果，能避免盲目用药带来的毒副反应和大量资金浪费，使患者最大程度获益。 　　扬州友好医院病理科基因中心还提供健康风险基因检测（基因体检）项目，适合于有遗传疾病家族史的人群；已经明确患有某些常见疾病的患者及其亲属人群，如：肿瘤、高血压、冠心病、糖尿病等；生活习惯不规律，饮食结构不合理的人群，如：经常饮酒、抽烟，睡眠质量不佳；社会压力、心理压力较大的人群；工作环境或者生活环境恶劣的人群；还有希望获得健康规划，了解自身遗传特征和疾病易感性的人群。有这样需要的人可以前来咨询，本中心会根据每一个人的家族病史、本人的目前健康状况，提供“个体化”的基因检测方案，在征求本人意愿以后再实施，并承担保密义务。