泌尿外科是南京市重点专科，创建于上世纪80年代，是江宁医院较早成立，也是集医疗、教学、科研于一体的特色专科。设有泌尿外科门诊、病房、膀胱镜检查室、泌尿系结石碎石中心及男科工作站，拥有病床21张。现有专科医生8名，其中副主任医师5名，主治医师2名：博士1名、硕士3名。年门诊诊治患者上万人次，住院患者近千人次，手术300余台次，体外冲击波碎石400余人次。主要开展泌尿系统结石、感染（肾盂肾炎、膀胱炎、性传播疾病等）、肿瘤（包括肾、输尿管及膀胱肿瘤等）、畸形、女性尿失禁、男性前列腺疾病（前列腺炎、前列腺增生）、男性不育等疾病的诊治。以泌尿及男性生殖系统的常规开放手术、微创手术、体外冲击波碎石、腔内钬激光碎石为主要诊疗手段，以泌尿系结石防治基地和男科学为科室的鲜明特点。 泌尿外科常规开展膀胱全切＋乙状结肠代膀胱术、肾癌根治术、保留肾单位的肾癌手术、肾窦内肾盂切开取石术、耻骨上经膀胱前列腺摘除术、前列腺癌根治术、后尿道吻合术、尿流改道术；尿道畸形的矫形术；尿道中段吊带悬吊术；经尿道前列腺电切术、经尿道膀胱肿瘤电切术、膀胱镜或输尿管镜下钬激光碎石术、经皮肾穿刺钬激光碎石术；开展腹腔镜下肾囊肿去顶减压术、肾上腺肿瘤切除术等。