肛肠外科是我院的重点专科之一。科室拥有痔疮综合治疗仪及先进的各种手术方法和内痔注射萎缩疗法，使患者愈合期短、出血少、痛苦小、复发率低、治疗彻底，深受广大患者的好评。科室现有医务人员5名。每周二、周日上午杭州海军疗养院肛肠科专家定期坐诊指导，有效推动了医院肛肠疾病治疗技术的发展。科室开展肛瘘（包括复杂性肛瘘）、各类痔疮、急慢性肛裂、肛门狭窄、肛门搔痒症、直肠息肉、肛门瘙痒症、直肠脱垂等肛肠疾病的手术。已开展的“菱形切口外剥内扎治疗混合痔，消痔灵注射治疗内痔”取得良好的疗效，深受广大患者的好评，