神经内科是医院的重点科室之一，设置有重症病房、卒中单元病房、康复训练室、优质病房、普通病房及阳光活动室。在专科建设方面，神经内科主攻脑血管疾病和癫痫等发作性疾病，擅长于治疗脑出血和脑血栓形成（脑梗塞），率先在江西省开展颅内血肿微创清除术治疗脑出血，效果良好，成功挽救了许多病人的生命；采用超早期静脉溶栓治疗早期脑梗塞取得了良好疗效；在结合针灸、物理作业疗法对各种瘫痪患者进行康复治疗，效果显著；在颅内感染性疾病、帕金森病、周围神经病变、头痛头晕等疾病的诊断治疗方面处于市内领先水平。