呼吸内科是国家级重点学科、全军呼吸内科研究所、全军“重中之重”建设学科、重庆市高校重点学科、重庆市医学领先学科;临床医学博士后流动站、呼吸内科博士学位授予点;国家药物临床试验机构呼吸专业。
呼吸内科有共有床位161张,其中普通病房床位147张,呼吸危重监护病房设14张床。有各类专业人员100余人。其中教授6名,副教授9名,博士生导师5名,硕士生导师7名,具有博士学位35名,共招收培养博士后10名,博士110名,硕士125名,进修生205名。获得国家科学技术进步二、三等奖各1项、军队及省部级科学技术进步一等奖1项、二等奖20项、军队医疗成果一等奖2项、二等奖2项、军队教学成果二等奖1项。
呼吸内科前身为西南军区总医院结核科,成立于1950年。1978年开始组建呼吸专科中心,同年被批准为呼吸内科硕士学位授予点。1984年被批准为全军呼吸专科中心,1986年被批准为呼吸内科博士学位授予点,1995年被评为四川省重点学科,并于当年升格为全军呼吸内科研究所。1996年启动了临床医学博士后流动站,其实验室1996年被评为四川省呼吸疾病基础研究实验室和全军呼吸重点实验室。1999年评为重庆市重点学科和重庆市医学领先学科,实验室被批准为重庆市重点实验室和重庆市人类疾病基因研究所。2001年被批准为呼吸内科国家重点学科,2007年通过国家重点学科的复审。2007年建立了第三军医大学呼吸病专科医院。在毛宝龄、郭先健、钱桂生教授等老主任带领下,新桥医院呼吸内科已经成为在国内同行中有重要影响力的学科。