器官移植科于2003年初由泌尿外科肾移植组与普通外科肝移植组合并而成，同年12月17日被解放军总后勤部批准为中国人民解放军第一家器官移植研究所。中心的肾移植开始于1978年6月，在贺宗理、何长民及闵志廉等老一代教授的关心下，经30多年的实践，肾移植技术在国内始终保持领先地位，截止2013年底，累计完成各类肾移植手术4230余例，其中小儿肾移植数量国内第一，活体肾移植数量每年保持在30例次。 　　器官移植科的肝移植开始于1996年5月，在徐冠南、徐学俊等老一代教授的指导下，经20多年的发展，肝移植技术在国内达到先进水平，至2013年底，累计完成各类肝移植手术1238例，其中第一例肝移植受者已健康存活18年，为国内公认肝移植术后存活最长记录保持者，此外，中心在小儿肝移植、活体肝移植、肝肾联合移植、胰肾联合移植等领域均有较快的发展。中心研制的肾脏保存液、多器官保存液经过国内95%的单位20多年的使用，证明为国产器官保存液的杰出代表。 　　器官移植科平均每年获得国自然、军队科技、上海市科委等课题基金10余项、累计金额300万元，平均每年发表SCI论文10余篇、累计IF25分，中心先后获得国家科技进步二等奖一次、军队医疗成果一等奖一次、军队医疗成果二等奖二次，获得国家专利授权5项。中心现为国家重点学科、全国器官移植委员会副主任委员单位、解放军器官移植委员会主任委员单位、中国免疫学会移植免疫分会副主任委员单位。中心平均每年培养博硕士研究生6名。中心目前开设床位67张，有各类人员60余名，其中高级职务15名。研究所设6个实验室，为全军独具特色的器官移植研究、手术治疗和人才培养基地。