外科目前有副主任医师2名，主治医师2名，住院医师2名，均先后到省、市级医院进修学习，具有较高的医学理论知识和丰富的临床诊疗经验。下设普外科、肛肠科、泌尿科、脑外科。普外科：开展了甲状腺癌根治术，胃大部分切除术，直肠癌根治术、肠部分切除术，肝癌切除术、肝破裂修补术，胆总管探查+切开取石术，脾切除术，乳腺癌根治术，腹股沟疝补片修补术，阑尾切除术，大隐静脉曲张抽剥术等各类手术。最新引进美国史赛克腹腔镜、胆道镜，开展腹腔镜胆囊切除术等微创手术。肛肠科：采取中西医结合治疗肛管炎、溃疡性结肠炎有独特疗效。配备有痔疮治疗仪、结肠途径治疗机、智能型肛肠熏洗仪，开展各类痔切除术、直肠脱垂悬吊术、肛瘘切除术、直肠息肉摘除术、肛门成形术、吻合器痔环状切除术（PPH术）。通过多年努力，逐渐形成了“庆元县中西医结合肛肠治疗中心”。泌尿科：肾、输尿管结石采用体外震波碎石+中药排石治疗，疗效满意。引进膀胱镜，开展膀胱镜检查，膀胱结石采用膀胱镜取石，提高了膀胱疾病的诊断率和治愈率。开展前列腺摘除术、尿道断裂修补术、精索静脉曲张术、包皮环切除术等手术。脑外科：由于交通业和建筑业的迅猛发展，脑外伤的致死、致残率不断提高。该科选派人员到浙江大学附属第二医院进修脑外科，提高对脑外伤疾病的抢救水平，配备有PB760高级呼吸机。现已熟练开展急性硬膜外、硬膜下、脑内血肿清除术和慢性硬膜下血肿钻颅引流术、颅骨凹陷性骨折整复术、颅骨缺损修复术、高血压脑出血血肿清除术等脑外科手术。