中医外科应用现代医学以外科手术为主要治疗手段治疗外科各种急慢性疾病。如：普通外科的甲状腺、乳腺、周围血管病变、各种腹壁疝修补；腹部外科的胃、肝、胆、脾、胰手术、泌尿外科的肾、肾上腺、输尿管、膀胱、前列腺、阴囊、阴茎病变的手术；神经外科的颅脑损伤、颅内出血、颅脑肿瘤以及先天性脑发育畸形的手术治疗。外科还与福建医科大学附属第一医院、附属协和医院、省立医院、省人民医院、闽东医院长期建立业务技术协作，同时开展胸部外科手术及疑难病例会诊，方便患者节省费用。