普通外科位于医院新建住院大楼四层，是南京军区创伤外科中心重要组成科室之一、安徽医科大学硕士研究生授予点、合肥市道路事故急救中心主体科室。是集医疗、教学、科研、国防保障为一体的重点科室。设置床位84张，其中SICU病房床位12张，年收治住院病人2000余人，年门诊量约2万人次，年手术2000余例，治愈率达95%以上。病房环境舒适，均为三人小病房，配备空调、有线电视及独立卫生间;设备一流，拥有德国产Storz高清晰度腹腔镜2台(其中全数字高清腹腔镜1台)、Olympus超声刀1台、ERBE电刀工作站1套、pentax胆道镜1台、高级进口呼吸机6台、多参数监护仪16台、床边B超机1台、除颤仪1台、微量血糖仪及输液泵多台，还拥有中央监护系统和完善的营养配置室;科室技术力量雄厚、业务娴熟、服务优良， 　　普通外科现有医护人员60余人，其中高级职称18人，主任医师2人，副主任医师1人，主治医师11人，设胃肠外科、肝胆外科、颈胸血管疝三个专业组。胃肠外科以肿瘤外科为重点，长期从事消化系统良恶性肿瘤的基础和临床研究，擅长各种恶性肿瘤的根治、围手术期处理和综合治疗(如以手术为主的胃、结直肠恶性肿瘤个体化治疗)，手术切除成功率及长期生存率在省内处领先水平；腹腔镜胃肠道肿瘤的根治、PPH术(吻型内合器环痔切除术)等微创手术正逐步走向成熟；另外肠瘘的专科治疗在省内保持领先水平。肝胆外科擅长肝胆胰脾复杂疾病的诊治和围手术期处理，尤其对肝胆胰恶性肿瘤根治有独到之处；90年代在省内较早开展了临床同种异体肝移植，同时是安徽省早期开展腹腔镜手术的单位，开展腹腔镜胆囊切除10000余例，无不良后果，腹腔镜脾切除及门脉高压贲门周围血管离断正逐步开展；腹腔镜手术拓展和手术技术改进获全军科技成果奖。颈胸血管疝外科开展了乳癌的保乳手术，术后乳腺外形保持不变，配合放射治疗和化疗，达到了与传统根治手术相似的治疗效果；乳腺小肿块术前超声检查细针穿刺定位手术，解决了乳腺小肿块术中定位困难问题；在甲状腺手术的切口缝合上，特别注意切口的美观，采用较小的切口和美容缝合，术后切口瘢痕小，外形美观，受到患者的欢迎；开展了无张力疝修补手术，目前已完成近500例，该手术采用国产或进口疝修补材料，特别适用于中、老年人疝、巨大疝及复发疝，术后疼痛明显减轻，疝复发率较传统手术明显下降;腹腔镜疝修补、甲状腺切除等微创手术也在逐步开展。