呼吸科是以收治呼吸道疾病及泌尿系统疾病为主的科室。现有主要业务骨干包括：主任医师1人、副主任医师4人以及多名主治医师、主管护理师等，其中研究生3人、在读研究生3人。科室现有编制病床48张，每年平均收治病人2000余人次。开设了呼吸、哮喘、泌尿（遗尿）专科门诊。在急性呼吸道感染及泌尿系统疾病诊治方面独具特色。 　　呼吸科室致力于ARI病原学研究。其范围涉及病毒、细菌、非典型病原，为ARI的规范治疗提供了科学依据。相关研究曾分获市科委、省卫生厅科技进步三等奖。在难治性肺炎中率先发现MRSA、PRSP、ESBLs、霉菌性肺炎病例。在降低儿童肺炎死亡率方面，积极探索早期干预治疗及综合治疗措施，并积累了较丰富的经验，大大降低了重症肺炎死亡率。作为全国儿童哮喘协作组成员单位，2006年经上级批准成立“昆明市儿童哮喘临床诊疗中心”，集医疗、科研、教学、培养、健康教育为一体。于2000年与全国同步在昆明地区进行儿童哮喘流行病学调查，在贯彻哮喘防治的GINA方案中，较早开展以吸入疗法为主的治疗方法，在哮喘病诊断、治疗、预防及管理上与全国同步，开设每周2次的哮喘专科门诊，在疑难呼吸系统疾病诊断方面，与其他科室合作，开展了小儿纤维支气管镜、气管镜、CT扫描、CT引导下胸穿、肺穿刺、肺功能测定、过敏原检测等技术的应用，尤其是小儿纤维支气管镜和肺功能检查为其特色。能开展肺泡灌洗液检查。可以诊断诸如支气管扩张症、肺间质纤维化。先天性肺、支气管发育异常、气管狭窄、艾滋病等疑难复杂病例。 　　在泌尿系统疾病诊治方面，与泌尿外科，放射科等合作，开展小年龄静脉肾盂造影、膀胱镜、尿道造影、左肾脏静脉B超、CT扫描等技术。并拟开展小儿肾穿刺、血透疗法等技术。全面开展了尿分析工作站、尿红细胞形态分析、尿微量蛋白系列、尿钙、尿肌酐测定，并常规进行肾脏生化检查及肾功能检查。除诊断、治疗常见小儿泌尿系统疾病外，在肾病综合征的规范治疗与管理，减少与预防复发方面做出了积极的探索，在儿科难以开展透析疗法的情况下，该科采取综合治疗非透析疗法成功抢救多例急性肾功衰患儿。在疑难复杂的泌尿系统疾病中，诊断了先天性肾、输尿管畸形、返流性肾病、肾肿瘤、尿道异物、肾脓肿等病例。