感染科于2003年非典流行后，在发热门诊、肠道门诊的业务构架基础上成立了感染科门诊窗口。分别设立了发热门诊、肠道门诊、艾滋病自愿咨询室，室内布局合理，设施齐全，人员配备达标，除完成日常工作外，还负责完成本院以及昆明市各项指令性任务、突发公共卫生事件的应急处理及应急物资发放。被指定为昆明市疫情重点监测医院，VCT点。 　　业务范围： 　　肠道门诊：以急性腹泻为主的各种疾病，包括霍乱、伤寒和副伤寒、痢疾、感染性腹泻、细菌性食物中毒。 　　发热门诊：排查疑似传染病，发热病因诊治。 　　艾滋病自愿咨询室：为求询者完成检测前、后咨询及转介服务，为艾滋病传播高危人群提供健康宣教及心理安抚指导。