北京佑安医院肝病消化中心是医院重点科室之一。1993年正式成立，经北京市卫生局批准，2000年成立北京市肝病内镜诊疗中心。 　　北京佑安医院肝病消化中心包括有肝病消化一科和肝病消化二科以及消化内镜中心。共有床位90张。主要收容各型肝病患者，包括各型病毒性肝炎、酒精性肝病、自身免疫性肝病、药物性肝病等。主要医疗特色治疗消化道出血，消化性溃疡，各种胃肠道疾病，肝硬化合 并症，例如脾脏功能亢进，腹水，肝性脑病，肝胆肿瘤等。 　　北京佑安医院肝病消化中心金瑞、丁慧国等国内知名教授、专家担任科室学科带头人， 承担了多项国家和北京市科研项目。获得多项国家和北京市科技进步奖。多年来，培养出众多博士生和硕士生。 　　北京佑安医院消化内镜中心占有面积达400多平方米，拥有价值数千万元的现代化进口内镜设备。包括高清晰电子胃镜、放大胃镜、大肠镜、十二指肠镜、超声胃镜、鼻胃镜、胶囊内镜、C13/C14HP检测仪、胃肠电图仪等。目前设备已达到或超过国内三级甲等综合医院先进水平。目前，消化内镜诊断与治疗已成为本院临床一项很重要的手段。不断创新，不断发展，已初步形成科室的特色。