首都儿科研究所呼吸内科创建于1958年，1960年成立呼吸病房，1975年发展呼吸专业并建立呼吸功能室，并开展急性呼吸衰竭的呼吸器治疗，1980年成立哮喘专业门诊，1984年开展反复呼吸道感染(RRI)及免疫治疗门诊。1985年与国内协作组合作，牵头正式成立了中华医学会儿科分会呼吸学组。1992年成立哮喘防治、教育中心。首都儿科研究所呼吸科目前为我院重点科室。 　　首都儿科研究所呼吸内科1986—1988年在国际儿童基金会(UNECF)资助下，在分布于我国南、北、中部的社区进行了大规模的小儿肺炎流行病学的调查，并引用WTO的病历管理方法结合我国情况建立一套有我国特色的管理方法，开展小儿肺炎的防治工作，1986年在山西稷山县进行的肺炎监测中，发现流行性喘憋肺炎流行，并证实其病原为呼吸道合胞病毒(RSV)，为此后该疾病的诊断及治疗做出了巨大贡献。2000年12月，我所申请获得“首都医学发展科研基金”支持的重点呼吸学科;2002年，呼吸科正式组建国内第一个系统的、规范的儿科门诊呼吸治疗室，在为患儿提供更好的医疗服务的同时，进一步探索我国呼吸治疗医师的培养方向。同年成立了纤维支气管镜室，用于呼吸系统疑难病的诊断和治疗。在科研方面：呼吸科与临床实验室、高科技实验室等合作，在呼吸道疾病病毒监测与检测的研究方面，取得多项突破。2003 年2月成立了北京市儿童呼吸系统疾病诊断治疗中心，此项目得到北京市政府的资助，为北京市重点扶植的学科。 　　首都儿科研究所呼吸内科现设有哮喘中心，还设有纤维支气管镜室、呼吸睡眠监测室、肺功能室、呼吸治疗室等。