胸外科是一个集临床、教学、科研及管理为一体的学科，是国家级临床重点专科、广东省和广州市重点学科，作为全国首家胸外科卫生部培训基地，是华南地区唯一拥有肺移植资质的医疗机构。 　　胸外科继续巩固原有优势，在何建行教授的带领下，以建立研究型科室为出发点，向胸外科移植领域努力开拓，2003年成功完成华南地区第一例临床同种异体肺移植。迄今为止，本学科已经成功完成53例临床肺移植，是全国完成临床肺移植手术例数最多的单位之一，成为卫生部批准的第一批肺移植资格单位。此外，本学科还进行了众多技术创新，推动胸外科技术再上新台阶，例如：2007年开始使用肌皮瓣转移技术修补巨大食管、气管缺损，解决了进行此类手术时需要面对的“选择修补材料”和“选择手术方式”这两大难题；2011年开展非插管胸腔镜手术；2012年引进瘤内放疗技术，将胸部手术从表面微创向整体微创推进。本学科还大力引进基因检测和蛋白质基因组学等先进技术，致力于研究和开展肿瘤病人的个体化治疗，其中，肺癌病人的个体化治疗成果发表在国际知名杂志《Lancet》、《JAMA》上。 　　胸外科由于拥有良好的学术传统，经过四十余年的发展，本学科逐步形成以微创诊治胸部疾病、早期肺癌诊治和呼吸系统器官移植为显著特色的产学研教平台，具备11个稳定的研究方向及研究团队，开展了与国际先进水平接轨的跨学科胸外科技术的临床应用。尤其在肺癌微创个体化诊治、局部晚期肺癌的扩大切除及重要脏器功能重建、复合型胸部创伤的功能重建、肺移植及气管移植、微创肺减容及肺大疱切除、肺部真菌感染疾病的外科治疗、胸腺瘤及重症肌无力的微创诊治、转肌皮瓣重建胸内器官技术、微创食管癌切除、微创胸外科器械研发、中国南方人肺癌肿瘤生物资源库、肺癌个体化治疗预后和肺癌多中心国际药物临床研究等方面走在了全国前列。 　　胸外科技术特色： 　　1、胸部微创伤外科技术； 　　2、以外科治疗为主的肺癌综合治疗； 　　3、肺癌的早期筛查与诊治； 　　4、肺癌的靶向治疗（消融，肿瘤淋巴靶向治疗等）； 　　5、晚期肺癌个性化疗法制定； 　　6、气胸、肺大疱和慢阻肺的外科治疗； 　　7、气管外科治疗； 　　8、胸部同种异体器官移植； 　　9、自体组织移植。 　　胸外科重大成功手术 　　1、1963年，以李迎汉为首的胸外科专家完成了亚太地区首例成功的“深低温体外循环下直视全主动脉弓置换术”，获得全国科技大会一等奖； 　　2、1984年，胸外科著名专家杨运有教授，吴哲凡主任医师率先广东省内进行心包内处理血管肺切除术和气管、隆突切除术等高难度的血管和气管外伤手术，以及肺癌食道癌的扩大根治术； 　　3、1994年，完成国内首例胸腔镜微创肺叶切除术； 　　4、1996年，进行国内首例胸腔镜肺气肿减容术，率先推行针型胸腔镜手术； 　　5、1996年开展胸腔镜肺气肿减容术，并提出其作用机制新解释；被《中华外科杂志》评为中国外科史50件大事记之一； 　　6、1996年在国内率先开展胸腔镜胸腺切除术； 　　7、1999年，完成亚太地区首例同种异体气管移植术； 　　8、2003年，完成中南地区首例成功的同种异体肺移植术，患者术后恢复良好，生存期已超过8年，创造国内肺移植的一项纪录； 　　9、2004年完成利用转移肌皮瓣修补巨大气管缺损以及治疗气管肿瘤，为国际上首次报道； 　　10、2007年开始建立亚太地区肺癌肿瘤标本库，至今已收集超过20000例数肺癌标本。