心血管外科是集医疗、教学、科研为一体的目前福建省最大的心血管外科基地。有编制床位100张，ICU病床12张，专用的净化手术室5间。麻醉机、体外循环机、呼吸机、监护系统、各种手术器械及相应设备均从国外进口，还有专供研究生科研使用的研究室及动物实验室。科室技术力量雄厚，现有主任医师、教授、博导1人，副主任医师2人，主治医师4人及住院医师数名。心外科医师80%以上具有硕士、博士学历。 　　心血管外科与世界知名的德国柏林心脏中心、德国洪堡大学Charite医院、美国新泽西心脏中心的心外科是姊妹科室，每年定期双边互派人员交流。在国内，科室还与北京阜外医院、上海中山医院、上海新华医院儿童医学中心、四军大西京医院的心外科建立了稳固的协作关系。科室自二OO一年九月成立以来，瞄准建设成省内领先、全国一流的心血管外科的目标，一路上高歌猛进，捷报频传，完成了福建省首例人工心脏植入术、福建省首例ROSS手术，福建省首例室间隔缺损的介入封堵术、福建省首例瓣膜置换术中房颤微波消融等在内的多项填补厦门市和福建省空白的手术；二OO二年即科室成立后的首个完整年度，心外手术量就突破410台，比科室成立前整个厦门市五十二年间开展的心脏手术总量还要多；2003年度，克服了SARS的影响，科室手术总量又达512台，突破了心血管外科发展史上很难突破的500台大关。至2003年12月30日，其手术数量累计已突破1024台，发展速度全国一流，被誉为“新厦门速度”。 　　心血管外科的业务涵盖了心血管外科的各个方面，开展了填补福建省和厦门市空白的新技术新方法达20余项，在这里手术者上有年迈80多岁的老人，小至出生后仅16个小时的婴儿，病人除来自厦门及周边地市外，还有来自祖国四面八方的14个省区的患者，这里大病、难病病人多，而手术死亡率逐年下降，2002年是2.1%，2003年更降到1.2%，为国内先进水平。